Jak uložit laboratorní notebook

fpfcorp 01/10/2021 1353

Cultura Creative (RF)

/ Alamy Stock Photo

Kam jsem dal ten kus papíru? Kdy jsem provedl ten experiment? Kam jsem ten datový soubor uložil? Pokud se často přistihnete, že hledáte kritickou informaci, kterou jste si poznamenali, když jste experiment prováděli, snažíte se vzpomenout si, kdy jste co udělali, nebo prohledáváte pevný disk, abyste našli správný soubor, možná je čas znovu se zamyslet nad tím, jak výzkumné poznámky. Ať už pracujete na lavičce, v terénu nebo teoreticky, musíte mít přehled o tom, co děláte, abyste se k tomu vy a ostatní mohli kdykoli vracet.

Kromě tradičního papírového zápisníku je k dispozici řada nástrojů, které vědcům pomáhají dokumentovat jejich práci a pokroky, ale jak si vést dobrý zápisník, se učí jen zřídka. Mnoho výzkumných institucí, financujících orgánů a profesních sdružení má požadavky nebo nabízí pokyny. Ale kromě ujištění, že neporušujete žádná pravidla, je často prostor pro kreativitu a osobní preference – za předpokladu, že je psaní poznámek efektivní.

Věda

Careers požádali výzkumníky z různých oborů a kariérních stupňů, aby se podělili o tipy a strategie, které pro ně fungují. Jejich odpovědi byly upraveny pro srozumitelnost a stručnost.

Vedení výzkumného zápisníku je často považováno za práci. Proč je důležité věnovat tomu dostatek času a úsilí?

Laboratorní notebooky jsou jako jít k zubaři – nikoho to nebaví, ale pokud to neuděláte, vypadnou vám všechny zuby. Laboratorní zápisníky jsou nejužitečnějším zdrojem, který si můžete v laboratoři vytvořit, a vytvoření dobrého zápisníku vyžaduje každý den trochu úsilí. Jakmile si osvojíte návyk a budete mít systém, který se vám líbí, bude méně náročný.

-

Caroline Bartmanová

, postdoktorand v kvantitativní metabolomice na Princetonské univerzitě

Můj laboratorní notebook zaznamenává všechny mé výzkumné experimenty a všechna moje selhání a optimalizace. Je to skvělý nástroj pro zachování přesnosti a reprodukovatelnosti – pokud si nepamatuji, jak jsem provedl experiment nebo jak jsem analyzoval data, všechny tyto informace jsou v mém notebooku. Je to také mnohem snazší pro vaše budoucí kolegy z laboratoře, kteří možná potřebují provést podobný experiment a chtějí vidět, co jste již vyzkoušeli.

-

Maiko Kitaoka

, Ph.D. kandidát v molekulární a buněčné biologii na University of California, Berkeley

Důsledný záznam mých experimentálních kroků mi pomohl pochopit určité výsledky. Zaznamenání toho, co se stalo v konkrétní den, vám může napovědět, zda některá data nejsou odlehlá kvůli faktorům prostředí, jako je změna teploty. Postupem času se z mého laboratorního zápisníku stal také nástroj pro sledování mých nápadů. Možná nebudete chtít měnit svůj design nebo metodu přímo uprostřed experimentu, ale váš notebook je perfektní místo, kde si můžete poznamenat, co byste mohli chtít vyzkoušet příště.

-

Valentina Ferro

, držitel Ph.D. v experimentální fyzice a ilustrátor na volné noze v Seattlu, Washington

Další z našeho seriálu Jak na to

Jak napsat Ph.D. teze

Jak držet krok s vědeckou literaturou

Přečtěte si úplný seznam Jak na to

V teoretické oblasti, jako je ta moje, je notebook nezbytný pro sledování mých pokusů o vyřešení problému. Bez dobře napsaných poznámek bych tytéž výpočty provedl asi mnohokrát. Notebook je také užitečný pro sdílení mých přístupů a výsledků se spolupracovníky.

-

Matteo Falessi

, postdoktorand v oboru fyziky plazmatu ve výzkumném centru ENEA Frascati v Itálii

Návrat ke starým údajům bez silné dokumentace může být trochu jako archeologická expedice. Dobrý notebook umožňuje rychle zjistit, jaké experimenty byly provedeny as jakými cíli, přehodnotit stará data ve světle nových poznatků a vyzvednout práci tam, kde jste ji nechali. Obecněji řečeno, dobré poznámky umožňují reprodukovatelnost výzkumu; poskytnout písemný důkaz, že vše bylo provedeno jasným, transparentním a etickým způsobem; a nabídnout zdůvodnění, proč byly učiněny určité výzkumné volby.

-

Caroline Lynn Kamerlin

, profesor strukturální biologie na univerzitě v Uppsale ve Švédsku

Pokud píšete papír měsíce nebo dokonce roky po dokončení experimentů, váš laboratorní zápisník bude obsahovat všechny podrobnosti, které potřebujete k přesnému popisu vašich metod a výsledků. V určité fázi své kariéry jej možná budete muset použít také k poskytnutí důkazu, že nápad byl skutečně „vaše“, nebo k uplatnění nároku na vaše duševní vlastnictví. Navíc v případě obvinění z vědeckého pochybení bude váš laboratorní notebook nepostradatelným prvkem při vyšetřování. Nakonec bude laboratorní notebook fungovat jako účetní kniha vaší kariéry a stane se součástí vašeho dědictví jako vědce. Nezanedbávejte to!

-

Jeremy C. Borniger

, postdoktorand v oboru neurovědy na Stanfordské univerzitě v Palo Alto v Kalifornii

Používáte tradiční papírový zápisník, digitální nástroje nebo jejich kombinaci?

Rád používám ručně psaný zápisník, i když většina dat, která vytvářím, je digitální. Příležitostně také zaznamenávám technické detaily – jako konkrétní nastavení snímání na mikroskopech nebo které experimenty jsem spojil, abych vytvořil obrázek – do textových souborů, kde je najdu nejsnáze. Jedním z problémů tradičního papírového poznámkového bloku však je, že v něm není vždy snadné vyhledávat, takže prvních pár stránek používám k udržování obsahu a co nejčastěji křížově odkazuji na své digitální datové soubory.

- Kitaoka

Považuji elektronický laboratorní notebook za mnohem lepší než papírový. Lze v něm vyhledávat, takže mohu snadno získat záznamy o experimentech, které jsem provedl před lety, nebo jej pročíst, abych našel klíčové detaily. Nikdy to nezničím tím, že náhodou postavím kádinku s etanolem. A dokud to zálohujete, je nemožné prohrát. Navíc to musím vyplnit u svého stolu bez rukavic, což mě nutí věnovat tomu vyhrazený čas.

- Bartman

Od začátku své výzkumné kariéry jsem používal papírové sešity, ale postupem času jsem musel svou strategii upravit, protože jsem se na všech těchto stránkách ztrácel. Dnes používám svůj laboratorní notebook jen k tomu, abych si dělal rychlé poznámky, když jsem pryč. Všechny mé optimalizační plány, nezpracovaná data a analýzy jsou uloženy v počítači. Používám datum a krátký popis každého experimentu ke křížovému odkazování na záznamy v poznámkovém bloku a na počítačové soubory. Kromě toho považuji za užitečné vést si samostatný rešeršní zápisník pro širší témata, jako je konceptualizace experimentů, sepisování rukopisů, organizování schůzek nebo psaní poznámek na schůzkách.

-

Karine Salin

, stálý vědecký pracovník v oboru fyziologie životního prostředí na IFREMER v Plouzané, Francie

Dostávám více nápadů na papír, takže jsem zpočátku chtěl mít za každou cenu tradiční notebook. Ale pracoval jsem na několika projektech a potřeboval jsem, aby byl můj notebook prohledávatelný a označovatelný, aby bylo možné snáze sledovat. Sladkou tečkou pro mě bylo používání digitálního notebooku, jako je Evernote, se schopností zahrnout snímky tradičních poznámek z pera a papíru, stejně jako kódovací skripty a další digitální soubory a obrázky, které jsem vygeneroval. Navíc, mít aplikaci v telefonu znamenalo, že jsem mohl nahrávat hlasové poznámky při chůzi, pokud jsem dostal nápad, který bych chtěl zkusit později. S digitálním zápisníkem je však téměř nemožné najít věci, na které jste zapomněli, jako byste to našli pouhým listováním stránkami papírového zápisníku. Problém jsem překonal tak, že jsem označil vše, co bylo pro experimenty trochu méně relevantní – například nesouvisející nápady a další otázky, které je třeba sledovat – tagem „náhodné“, takže jsem je mohl tu a tam procházet a hledat inspiraci.

- Ferro

Na většinu mé práce mi stačí papírový zápisník. Ujišťuji se však, že vytvořím digitální zálohu všech poznámek vyfotografováním pomocí aplikace Genius Scan nebo jejich zapsáním do aplikace Microsoft Word. Mám také počítačovou složku, kam ukládám všechny své standardní protokoly, takže se na ně mohu jednoduše odkazovat, místo abych to celé zapisoval do notebooku pokaždé, když dělám experiment. Kromě toho mám pro každý řádek práce samostatné pořadače se štítky, kam vkládám poznámky a data, která se do poznámkového bloku snadno nevejdou, jako jsou výtisky z Microsoft Excel, grafická data, smlouvy a smlouvy o převodu materiálu.

- Borniger

Svůj digitální zápisník píšu v režimu Org, což je značkovací jazyk speciálně navržený pro snadné vkládání ručně psaných obrázků, jako jsou výsledky, výpočty, rovnice, tabulky, bibliografie a dokonce i části kódu. Samotný zápisník se skládá z několika propojených souborů ve formátu prostého textu, takže když mám papír na psaní, mohu textové soubory snadno použít jako koncepty tím, že je exportuji do souboru LaTeX.

- Falessi

Používám hlavně elektronický poznámkový blok, ale často si v laboratoři nejprve zapisuji poznámky do papírového poznámkového bloku – nikdy to není útržek papíru – a poté papírový poznámkový blok naskenuji, abych měl kdykoli přístup k jeho obsahu. Pro elektronický záznam používám Confluence, ale Microsoft OneNote je další dobrá volba, protože jej můžete používat offline i online a je zdarma. Odkazuji pomocí čísel stránek z mého papírového poznámkového bloku a dat a názvů experimentů v názvech souborů. Všechny mé protokoly jsou v mém digitálním notebooku – často s obrázky mých experimentálních nastavení, materiálu, vybavení a někdy i videozáznamem, jak mluvím o každém kroku protokolu. Svá nezpracovaná data ukládám na server své laboratoře a zálohuji je do cloudu a na pevný disk. Můj kód pro zpracování a analýzu dat je na Github, populárním systému verzování softwaru. Nakonec si vedu seznam úkolů do svého elektronického zápisníku, který zároveň slouží jako záznam toho, co jsem každý týden dosáhl.

-

Lina Colucciová

,

pobočka zabývající se výzkumem v oblasti zdravotnických věd a technologií na Massachusetts Institute of Technology v Cambridge a podnikatel poskytující poradenství v oblasti datové vědy v oblasti San Francisco Bay Area

Jaké strategie používáte k tomu, aby byl notebook uspořádaný, úplný a v souladu s osvědčenými postupy?

Pro mě funguje to, že pořizování poznámek považujem za zásadní experimentální krok. Obvykle si věci zapisuji za pochodu, občas si zapisuji protokol nebo to, co se chystám udělat, než začnu experimentovat, a pak upravuji vše, co jsem udělal jinak, než jsem plánoval. Tímto způsobem je vedení laboratorního zápisníku podobné vaření, kde je úklid během celého procesu mnohem snazší než čekat až do konce, až se nádobí hromadí ke stropu. Vyplnění laboratorního zápisníku co nejdříve také snižuje pravděpodobnost, že zapomenete důležitou informaci nebo že uděláte chybu.

Pokud jde o uspořádání mého papírového poznámkového bloku, jednoduše dodržuji chronologické pořadí, takže každá stránka je nový den (pokud nepoužívám více stránek za den). Dávám pozor, abych uvedl podrobný popis toho, co jsem udělal, proč a jak

současnost

napjatý; datum, čas a místo, kde byla práce provedena; jména všech ostatních, se kterými jsem pracoval; zvláštní okolnosti, které se vyskytly během práce (například došlo k požárnímu poplachu, který mohl ovlivnit výsledky?); a můj podpis a kdykoli je to možné, svědecká značka (obvykle můj hlavní vyšetřovatel nebo kolega z laboratoře). To vše by mělo být napsáno perem, a pokud bylo něco špatně, neškrtejte to úplně; stačí přes něj vložit jeden řádek, aby se dal stále číst. Zapisování myšlenek (spíše než metodologie) je také přijatelné a podporováno.

- Borniger

V mém papírovém poznámkovém bloku je každý experiment shlukem po sobě jdoucích stránek, protože pro mě bylo příliš obtížné sledovat jednotlivé experimenty, pokud byly smíchány s jinými. Pokud dělám více experimentů najednou, nechávám pro ně mezi svými záznamy prázdné místo, aby všechny mé poznámky a protokoly týkající se jednotlivého experimentu byly průběžné, a to i pro vícedenní experimenty. Detaily notebook opravdu dělají nebo lámou, takže se snažím být stručný a zároveň obsahovat co nejvíce relevantních detailů.

- Kitaoka

Říkám svým studentům, že nemusí dodržovat konkrétní formát v papírovém sešitu, pokud tam jsou všechny informace a je snadné je najít. Nechám je zapsat, co mohou, než začnou experiment. Také je instruuji, aby postup zaznamenávali, protože často náhodně vynechají nebo udělají kroky mimo pořadí, a to je důležité zaznamenat. Jejich první experimenty budou pravděpodobně vyžadovat mnoho podrobností o tom, jak nastavit a provést postup – zatímco jakmile budou mít zkušenosti, budou si muset poznamenat pouze relevantní proměnné. Nikdy by neměli zaznamenávat samostatné poznámky, aby je mohli později zkopírovat, protože to nevyhnutelně vede ke ztrátě informací.

-

Danielle Solano

, docent a vedoucí katedry chemie a biochemie na California State University v Bakersfield

Jednou z nejtěžších věcí při údržbě laboratorního zápisníku je rozhodnout se, kdy napsat důkladný záznam a kdy napsat zběžný záznam. Vždy začínám tím, že si pro každý experiment zapíšu minimální množství informací. To obecně zahrnuje datum, čas, umístění, parametry protokolu, kde jsou data uložena, a – pokud používám kód – název skriptu a verzi kódu Github. Poté, jakmile si uvědomím, že konkrétní experiment není slepá ulička, napíšu delší zprávu popisující cíl experimentu; hypotéza; datum (data) sběru dat; odkazy na data, analytické skripty, poznámky pořízené v den sběru dat a úplný protokol; obrázky nebo videa experimentálního nastavení; Výsledek; závěry; a nakonec další kroky.

Věci udržuji v chronologickém pořadí a datuji každou stránku svého papírového sešitu a často uvádím místo, kde jsem provedl experiment, nebo si také napsal poznámky. Pokud si něco nalepím do poznámkového bloku, podepíšu se a uvedu datum přes pásku. Pokud se vrátím a něco na staré stránce změním, změnu podepíšu a uvedu datum. Pro svůj elektronický notebook plánuji automatické denní zálohy.

- Colucci

Na začátku svého prvního experimentu dne bych si na Evernote vytvořil poznámku s datem a průběžně k ní přidával, pořizoval snímky svých poznámek z pera a papíru v laboratoři a později jsem v aplikaci organizoval další poznámky. Na konci každého dne jsem si 15 minut přečetl svůj příspěvek a přeformuloval vše, co bylo nejasné, protože jsem to napsal příliš rychle, nahrál další obrázky nebo analýzy a přidal nějaké závěrečné myšlenky. Na závěr bych přidal vhodné označení.

- Ferro

Můj zápisník má dvě zastřešující části – jednu pro vylepšené protokoly, které jsem dal dohromady poté, co jsem několikrát provedl nový experiment, a druhou pro záznamy o experimentu. V této druhé části si zapisuji poznámky a pozorování na papír, zatímco provádím experimenty a později zapisuji informace do svého e-notebooku organizovanějším způsobem. Může být velmi nepříjemné vyplňovat svůj laboratorní notebook po provedení vyčerpávajícího a složitého experimentu, ale to může být ta nejkritičtější doba! Pro ty dny, kdy to opravdu musím odložit, si nechávám část svého stolu pro experimentální poznámky, které pak mohu použít k aktualizaci svého notebooku další den.

- Bartman

Nějaké další rady?

Důrazně doporučuji využít začátek výzkumných zkušeností jako zkušební období pro metody laboratorního notebooku, abyste našli přístup, který vám vyhovuje. Hlavním kritériem je, že je přímočarý a pohodlný na používání a snadno se zálohuje. Nicméně žádná metoda není dokonalá, takže se omezte na zkoušení tří nebo čtyř nástrojů. Zjistil jsem, že nevýhodou experimentování s řadou různých nástrojů je, že vaše data jsou rozptýlena mezi notebooky, což může velmi ztěžovat nalezení toho, co hledáte.

- Colucci

Kromě pokusů a omylů jsem se naučil, co by mělo být v mých poznámkách, tím, že jsem si přečetl sešity bývalých členů laboratoře a zjistil, co v popisu usnadnilo nebo ztížilo reprodukci experimentu. Nedostatek informací může být velmi frustrující a já chci, aby jakékoli pokračování mých experimentů bylo co nejhladší.

- Kitaoka

Za předpokladu, že neporušujete žádná pravidla, nebojte se vyvinout svůj vlastní způsob psaní poznámek. Jedna z institucí, které jsem navštívil, měla své vlastní pokyny, ale protože se mi osvědčil můj individuální přístup, rozhodl jsem se v něm pokračovat a jednou týdně přeložit svou práci do vyhovujícího sešitu. Mohlo by se to zdát jako práce navíc, ale pro mě to bylo buď to, že jsem to dělal, nebo jsem riskoval, že přestanu důsledně používat svůj laboratorní notebook, což by byla větší ztráta pro mě, moji laboratoř a dokonce i pro instituci.

Na první pohled se to může zdát jako fuška, ale sledování toho, co děláte, vám může skvěle zlepšit náladu. Výzkumný projekt se skládá z mnoha experimentálních vzestupů a pádů, ale většinou pádů, takže cítit se trochu modře a zbytečně je velmi běžné. Pohled zpět do notebooku vám umožní dát věci do perspektivy a uvědomit si, kolik toho ve skutečnosti dosahujete.

- Ferro

Uchovávání laboratorních poznámek je tak snadné propadnout trhlinami jako něco zdánlivě druhotného k provedení experimentů, ale je tak důležité pro archivační a referenční účely. Nikdy není pozdě začít se správnými návyky, takže se zamyslete nad tím, jak si uchováváte své poznámky – a pokud potřebujete upgrade, začněte jej implementovat do své rutiny ještě dnes!

- Kamerlin

Nejnovější: Měli by si studenti vždy ponechat své laboratorní sešity?

Další: Význam laboratorních notebooků